Geneza Instytutu Ekonomii i Administracji sięga 1997r. kiedy to na Wydziale Zarządzania i Administracji powstał kierunek Ekonomia. Podstawą do wydzielenia się struktur Instytutu była zgoda Ministerstwa Edukacji Narodowej na uruchomienie trzyletnich studiów zawodowych na kierunku Ekonomia począwszy od roku akademickiego 1997/1998.

W roku 2002 Ministerstwo Edukacji Narodowej i Sportu wydało decyzję w sprawie nadania uprawnień AŚ im. J. Kochanowskiego w Kielcach do prowadzenia studiów magisterskich na kierunku Ekonomia.

Uchwałą Nr 28/2004 z dnia 23.09.2004r. na kierunku Ekonomia na studiach pierwszego i drugiego stopnia studiów stacjonarnych i niestacjonarnych utworzona została specjalność: Regionalna Polityka Gospodarcza. Od października 2007 r. Instytut zmienił specjalność na kierunku Ekonomia na Gospodarka Regionalna. Natomiast mocą uchwały nr 88/2007 z dn. 13.XII. 2007 r. utworzone zostały następujące specjalności, które zaczęły obowiązywać od roku akademickiego 2008/2009.

• Ekonomika finansów i bankowości
• Finanse publiczne i skarbowość
• Gospodarowanie funduszami unijnymi

1. Zakład Mikroekonomii
         Kierownik Zakładu - Prof. UJK dr hab. Mieczysław Poborski
2. Zakład Makroekonomii
         Kierownik Zakładu - Prof. UJK dr hab. Henryk Pałaszewski
3. Zakład Statystyki i Ekonometrii
         Kierownik Zakładu - Prof. zw. UJK dr hab. Jarosław Jelejko
   
4. Zakład Gospodarki Regionalnej
         Kierownik Zakładu - Prof. UJK dr hab. Janusz Kot
5. Zakład Historii Myśli Społeczno-Gospodarczej
         Kierownik Zakładu - Prof. UJK dr hab. Zbigniew Gazda
6. Zakład Samorządu Terytorialnego
         Kierownik Zakładu - Prof. UJK dr hab. Piotr Bury
7. Zakład Prawa Administracyjnego
         Kierownik Zakładu - Prof. UJK dr hab. Paweł Chmielnicki
8. Pracownia Rozwoju Regionalnego Europy Środkowej
         Kierownik Zakładu - dr Marek Leszczyński
9. Pracownia Finansów i Rachunkowości
         Kierownik Pracowni - dr Małgorzata Garstka
10. Pracownia Informatyki
          Kierownik Pracowni - mgr Beata Stachurska

Instytut Ekonomii i Administracji włącza się w życie Regionu Świętokrzyskiego realizując badania naukowe pogłębiające wiedzę o gospodarce województwa. W latach 2006-2009 pracownicy Instytutu Ekonomii realizowali cztery projekty badawcze Europejskiego Funduszu Społecznego w ramach ZPORR działanie 2.6. Były to:

"Budowanie regionalnego systemu innowacji - analiza strukturalna gospodarki regionu świętokrzyskiego i jej wykorzystanie pod kątem podnoszenia konkurencyjności i innowacyjności regionu"

"Budowanie regionalnego systemu innowacji - cykl konferencji poświęconych podnoszeniu konkurencyjności i innowacynjości regionu".

"Kielceki rynek pracy pod lupa"

oraz

"Mapa lokalnego rynku pracy"

Obecnie w Instytucie Ekonomii i Administracji  prowadzone są badania własne koncentrujące się na najistotniejszych problemach polskiej gospodarki np.: "Ewolucja rynków pracy regionów słabo rozwiniętych", "Ocena jakości usług ubezpieczeń na życie w 10 lat po zawarciu umowy ubezpieczenia". Ponadto pracownicy również w ramach badań własnych prowadzą pogłębione studia nad historią gospodarczą np.: "Polityka gospodarcza w Polsce w latach 1918-1939 na tle analiz Michała Kaleckiego" oraz z zakresu Historii Myśli Ekonomicznej np.: "Rola państwa w gospodarce w poglądach przedstawicieli nurtu katolickiego II Rzeczypospolitej (1918-1939) Implikacje dla gospodarki w Polsce".

Efektem prac naukowo-badawczych są publikacje pracowników (w latach 2000-2009 było ich 279 ) oraz aktywne uczestnictwo w konferencjach naukowych. Instytut Ekonomii jest również organizatorem konferencji wśród których najistotniejszy jest cykl "Dylematy polskiej polityki społeczno-gospodarczej". W latach 2004-2009 zostały zorganizowane następujące konferencje:

1. "Absorpcja funduszy unijnych przez polskie rolnictwo" - konferencja zorganizowana przez Ministerstwo Rolnictwa i Rozwoju Wsi przy współpracy Agencji Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa i Instytutu Ekonomii AŚ w dn. 15.10.2004 r.
2. "Dylematy polskiej polityki społeczno-gospodarczej" - konferencja zorganizowana przez Instytut Ekonomii AŚ w dn. 26.11.2004 r.
3. "Gospodarka Polski na początku XXI wieku. Innowacyjność i konkurencyjność gospodarki" - konferencja w cyklu wieloletnim o tematyce: "Dylematy polskiej polityki społeczno - gospodarczej."- organizowana przez Instytut Ekonomii AŚ oraz Katedrę Teorii Ekonomii AE w Krakowie w dn. 23 - 24.05.2005 r.
4. "W Kierunku gospodarki opartej na wiedzy: innowacyjność, konkurencyjność, współpraca w regionie" - konferencja w cyklu wieloletnim o tematyce "Dylematy polskiej polityki społeczno-gospodarczej" 24-25 kwietnia 2006r.
5. "Konkurencyjność i innowacyjność regionów w warunkach globalizacji i metropolizacji przestrzeni" konferencja w cyklu wieloletnim o tematyce "Dylematy polskiej polityki społeczno-gospodarczej" 14-15 maja 2007r.
6. Forum samorządowo-gospodarcze „Jednostki samorządu terytorialnego  w procesie rozwoju regionalnego w zintegrowanej europie” V konferencja w cyklu wieloletnim o tematyce „Dylematy polskiej polityki społeczno – gospodarczej” 26-27 maja 2008 r. w Ostrowcu Świętokrzyskim.
7. „Perspektywy nauk administracyjnych” Sielpia k/Kielc 15-15 października 2008 r.
8. VI Ogólnopolska Konferencja Naukowa z cyklu: "Dylematy polskiej polityki społeczno-gospodarczej" pt. "FUNKCJE WŁADZ PUBLICZNYCH W GOSPODARCE RYNKOWEJ"  Łączna k/Kielc, 15-16 maja 2009 r.
9. "Polska administracja we wspólnej przestrzeni administracyjnej Unii Europejskiej" Kielce, 15-16 października 2009 r.
   

Od 25 II 2008 r. Instytut Ekonomii  zarządzeniem nr 5/2008 zmienił nazwę na Instytut Ekonomii i Administracji.

W roku akademickim 2008/2009 Instytut Ekonomii i Administracji uruchamia kolejny kierunek studiów - Administrację